Wdrożenie CMS jest tylko pierwszym krokiem w kierunku sprawnie działającego serwisu internetowego. Aby w pełni wykorzystać jego możliwości należy zadbać o prawidłową konfigurację, zainstalować rozszerzenia pozwalające dostosować system do własnych potrzeb oraz dbać o bezpieczeństwo serwisu. Terminem Administracja CMS określam ogół czynności związanych z zapewnieniem prawidłowego działania serwisu i jego rozwojem, czyli na przykład do zmieniających się trendów internetowych (np. kanały RSS, serwisy społecznościowe, mashup,...).